Chùa Yên Phú toạ lạc tại xã Liên Ninh, huyện Thanh Trì, thành phố Hà Nội xưa có tên gọi là Thánh Vân cổ tự, sau đổi thành Khánh Hưng tự. Tuy nhiên, người dân nơi đây vẫn quen gọi theo tên làng là chùa Yên Phú. Theo một số tài liệu ghi chép lại, chùa Yên Phú có vào khoảng năm 40 đầu Công Nguyên, nghĩa là đã có hơn 2.000 năm tồn tại. Vì lí do ấy mà chùa được coi là một trong những ngôi chùa có lịch sử lâu đời nhất Việt Nam. Cũng như nhiều ngôi chùa khác, chùa Yên Phú cũng kinh qua sự biến thiên của lịch sử và thời gian để rồi bị hư hỏng nặng nề. Trên nền móng của một chốn linh thiêng, ngôi chùa mới được xây dựng. Xét về mặt kiến trúc, chùa Yên Phú ngày hôm nay là sự tổng hoà của lối kiến trúc truyền thống pha với sự hiện đại. Vừa cổ kính, trang nghiêm vừa ứng dụng được nhiều vào đời sống. Chùa có hai cổng tam quan ở mặt phía Tây và mặt phía Nam. Cả hai cổng chùa đều nép mình dưới những tán cây xanh mát. Trước cổng tam quan nội có bức tượng Đức Phật Niết Bàn, hai bên là Phổ Hiền Bồ tát và Sư Lợi Bồ Tát, vừa tạo cảm giác uy nghi nhưng lại vô cùng yên bình. So với nhiều ngôi chùa khác, chùa Yên Phú toạ lạc trên một diện tích không quá rộng, nhưng khuôn viên của chùa được bài trí hợp lí để vừa không thiếu bất kì một hạng mục nào, lại vẫn tạo được cảm giác thoáng đãng, thanh bình. Trong sân chùa hệ thống tượng được đặt rải rác để du khách khi vãn cảnh chùa, ở bất kì một góc sân nào cũng đều cảm nhận được sự uy nghi của Phật pháp dõi theo. Xen giữa hệ thống tượng, được bao quanh bởi cây cối xanh mát, vườn tháp chùa Yên Phú cổ kính và trầm mặc. Vườn tháp chùa Yên Phú là công trình duy nhất của ngôi chùa cổ còn lưu giữ được cho đến hôm nay. Nằm giữa khuôn viên của chùa là chính điện 3 tầng, xây dựng trên một thế đất cao, hao hao chùa Quán Sứ. Phía trước chính điện đặt bức tượng Di Lặc như chùa Võng Thị. Hai bên chính điện là hòn giả sơn, phía dưới chân có ao cá mát lành tạo cảm giác thanh tịnh cho ngôi chùa. Mái chùa cong cổ kính. Các hạng mục được xây với không gian sử dụng lớn. Có thể thấy chùa Yên Phú ngày hôm nay vừa phảng phất nét truyền thống của ngôi chùa cổ hàng nghìn năm tuổi, lại mang dáng dấp hiện đại của một ngôi chùa được tu sửa lại trong thời đại mới.